Uccidere l'Idra era la seconda delle dodici leggendarie fatiche di Ercole. Tutte le volte che Ercole tagliava una delle teste dell'Idra, dal moncherino ne ricrescevano due. Ercole allora si fece aiutare da Iolao che, dopo che lui aveva tagliato una testa, cauterizzava con il fuoco il moncherino, impedendone così la ricrescita. Ercole, alla fine, schiacciò sotto un masso la testa immortale. Durante la battaglia, Era mandò un'altra creatura ad aiutare l'Idra, il Carcino (granchio), ma Ercole lo schiacciò sotto il calcagno. Ercole, uccisa l'Idra, immerse le sue frecce nel suo sangue velenoso, cosìcché le ferite da esse provocate fossero incurabili (un'accidentale puntura con una di tali frecce avrebbe provocato più avanti a Chirone atroci sofferenze). Euristeo comunque dichiarò la vittoria non valida, poiché Ercole aveva vinto con l'aiuto di Iolao. Era, finita la lotta, trasformò sia l'Idra sia il Carcino in costellazioni, rispettivamente l'Idra e il Cancro. Nella zoologia mitologica medioevale, il termine "idra" sta ad indicare un generico drago con molte teste. In alcuni bestiari medioevali è citato anche l'hydrus, un serpente nemico per antonomasia del coccodrillo dal quale si fa inghiottire per poi lacerarne l'intestino (analogamente a come faaceva l'icneumone, Erasmo da Rotterdam paragona, nei suoi "Adagia", la guerra all'Idra di Lerna.